销项负数发票是指企业在开票时发生了误操作，导致开具了“价税合计”为负数的发票，这类发票不能作为一般纳税人代表开具增值税专用发票使用。如果不处理好这类发票，会给企业日常纳税及税务审计带来极大的麻烦。
首先，企业需要纠正开票错误，重新开正数发票。同时，原负数发票需要做废处理，做废时需注明废票原因及废票日期，同时将已经认证过的销项负数发票的认证纳税申报表一并予以作废，并在下期纳税申报时进行冲账处理。
其次，企业需要注意及时处理销项负数发票，如果放任不管，会被税务机关认定为“假票”，轻则罚款并收回增值税专用发票核定，在重罚情况下，还会被列入“税务黑名单”，影响企业日后在税收方面的正常运营。